Masjid ini berdiri di atas lahan wakaf Dompet Dhuafa yang sebelumnya sudah ada bangunan Sekolah Smart – Dompet Dhuafa.

Masjid SMART merupakan pelengkap bangunan sekolah untuk membentuk kalangan insan kamil dari para civitas Sekolah Smart, siswa-siswi dan para guru.

Masjid SMART juga diharapkan menjadi magnet aktivitas sosial dakwah masyarakat sekitar agar tercipta sebuah harmoni bernafaskan nilai-nilai Islam, antara masyarakat di dalam sekolah dengan masyarakat sekitar.

Masjid SMART nantinya juga akan menjadi masjid modern yang melengkapi dirinya dengan fasilitas micro library dan sarana penunjang untuk mendapatkan pengetahuan modern.